Karl Freudenberger war gemeinsam mit seinem Bruder Siegfried Inhaber des seit 1891 bestehenden Schuhgeschäftes »S. & C. Freudenberger« in Bamberg. Das Geschäft unterlag 1937 dem Zwangsverkauf.
Zusammen mit seiner Ehefrau Sidonie (geb. Neuburger) wurde er am 9. September 1942 mit dem Transport II/25, Nr. 731 aus Bamberg nach Theresienstadt deportiert und kam dort am 12. März 1943 ums Leben, Sidonie wurde am 7. September 1943 ermordet.
Ihre Tochter Erna Nussbaum konnte 1939 aus Leipzig nach England fliehen und emigrierte später in die USA.